Neue Diagnose-Methode für Pilzinfektionen bekämpfen könnte weltweit eine der größten Gesundheits-Gefahr

Eine neue Studie Des Westmead-Institut für Medizinische Forschung (WIMR) hat gezeigt, wie dual DNA-barcoding könnte dazu beitragen, die Diagnose von invasiven Pilzinfektionen, Krankheiten, die Patienten den Zugang zu potenziell lebensrettende Behandlung viel früher.

Die frühzeitige Erkennung von Erregern—, die bestimmte Arten von Pilzen, die verantwortlich für die Krankheit—ist entscheidend dafür, dass die Patienten den schnellen Zugang zu Behandlung, Vermeidung von Komplikationen. Allerdings werden die derzeitigen diagnostischen Methoden sind zeitaufwendig, Komplex und nicht immer korrekt sind, was zu Verzögerungen in der Behandlung und unangemessenen Therapie, erhöht das Risiko von Morbidität und Mortalität.

Dual DNA-barcoding ist eine aufstrebende Technik, die verwendet wird zum identifizieren von pilzerregern. Es verwendet zwei einzigartige Regionen der DNA mit einer spezifischen pathogenen Pilzarten—die primäre barcoding region, internal transcribed spacer region (ITS) und des Sekundär-barcoding region, die translationale elongation-Faktor 1α (TEF1a).

Pilz-DNA extrahiert aus einer patientenprobe, wo es dann ‚verstärkt‘ oder multipliziert zu einer Erhöhung der Menge an DNA für die Sequenzierung zur Verfügung. Die DNA-Daten ist-Daten-abgebaut, und im Vergleich zu einer Referenz-Datenbank zur Identifizierung der Pilz-Erreger.

Obwohl die sekundäre Barcode-region eingeführt wurde, im Jahr 2017, seine Auswirkungen und die Wirksamkeit ist bisher nicht geprüft worden.

Lead-Forscher, Professor Wieland Meyer sagte: „Unsere Studie ist die erste, zu vergleichen, die Genauigkeit der beiden Barcode-Regionen, zu bewerten und die Wirksamkeit IHRER und TEF1a kombiniert.

„Wir waren in der Lage, korrekt zu identifizieren alle krankheitserregenden Pilz-Spezies, von der die meisten common human fungal pathogen Candida albicans, auf Arten, die selten zu Infektionen führen. Wir haben festgestellt, dass der primäre barcoding region allein konnte nicht erkennen, alle Arten—aber der sekundäre region, sowie die beiden kombiniert, diese Lücke geschlossen.

„Insgesamt haben wir festgestellt, dass die Kombination der beiden barcodes ermöglicht eine genauere Identifizierung von Pilz-Arten, besonders in Fällen, in denen ein einzelnes Barcode-system ist nicht in der Lage, das zu tun.“

Invasive Pilzkrankheiten (IFD), wie z.B. Cryptococcus neoformans-Infektionen oder Aspergillose sind eine zunehmende Bedrohung für die Globale Gesundheit, mit mehr als 1,6 Millionen Todesfälle zugeschrieben IFDs jedes Jahr. Neue Infektionen weiterhin entstehen, wie die neue multidrug-resistente Spezies von Candida, C. auris, welche die Fähigkeit besitzt, sich schnell zu verbreiten und dauerhaft in Gesundheit-Pflege-Umgebungen.

Professor Meyer sagte, „Identifizieren der Art von Pilzen verursacht die Infektion, wird uns helfen, verwalten entsprechende Behandlung schneller, die Verringerung des Schadens und, potenziell, die Sterblichkeitsrate im Zusammenhang mit IFDs.

„Es kann auch verbessern andere Komplikationen im Zusammenhang mit der IFDs, wie Resistenzen, und die finanziellen Auswirkungen IFDs auf die Patienten und das Gesundheitssystem.

„Während wir wissen jetzt, dass die dual DNA-barcoding-system ist wirksam bei der Identifizierung von Pilzarten, wir müssen Sie erhöhen die Menge der Sequenzen in Referenz-Sequenz-Datenbanken zu maximieren, die Anzahl der Arten, die wir identifizieren können.

„Wir sind jetzt Fragen, die Forscher aus der ganzen Welt zu senden Referenz-Sequenzen, die verwendet werden können zur Identifizierung pilzlicher Krankheitserreger.